Найдавнішими групами вважають хрящових риб (акул, схилів та химер). Хрящові існували 450-420 млн. років тому, а близько 350 млн. років тому з'явилися акули, подібні до сучасних. Серед кісткових риб найдавнішими є кістепері і дводихають. Обидві групи виникли 400–380 млн. років тому.