Потрапляючи через впускний отвір у сепаратор, паливо проходить через внутрішню систему лопатей, що надають йому обертального руху. Потік палива, що обертається, потрапляє в колбу, де завдяки відцентровій силі краплі води і більш важкі частинки притискаються до стінок колби і осідають на дні.