Бактеріальна клітина відрізняється від рослинної за складом та будовою клітинної оболонки. У бактеріальній клітині немає ядра, відокремленого від цитоплазми оболонкою. У рослинній клітині ядро є. Для рослинної клітини характерні пластиди, в бактеріальній вони відсутні, хоча деякі з них мають пігменти.
Клітини бактерій немає ніяких мембранних органел. Їхня цитоплазма не рухається. Рослинна клітина має ядро, мітохондрії, різні пластиди та інші мембранні органели. Цитоплазма рослинної клітини здатна до руху.
Відмінності рослинної клітини від тварини: 1) Рослинна клітина має міцну клітинну стінку значної товщини; 2) Рослинна клітина має спеціальні органоїди – пластиди; 3) Рослинна клітина має більш розвинену систему вакуолей.
Рослинна клітина має більший розмір ніж бактеріальна. Розмір рослинної клітини може змінюватись від 10 до 100 мк. А розмір бактеріальної клітини залежить від роду бактерій. Кулясті бактерії мають розмір в середньому 0,5 – 2 мкм, а паличкоподібні від 5 до 10 мкм.