Основна причина ІЦН – механічні пошкодження шийка матки: розриви під час пологів, травми при накладенні щипців; хірургічні втручання: конізація, ампутація – тобто ситуації, коли шийка була вкорочена; аборти, якщо неправильно проведено розширення цервікального каналу.
Найчастішими причинами короткої шийка матки є: недостатність прогестерону, вроджені аномалії розвитку, операції на шийці матці, ендоцервіцит, істміко-цервікальна недостатність (ІЦН), дисплазія сполучної тканини (ДСТ) 6
індивідуальні особливості будови статевих органів конкретної жінки; гормональний баланс (концентрація жіночих статевих гормонів – естріолу та прогестерону); вага плода (або плодів при багатоплідний вагітності), що здійснює тиск на шийку матки; наявність маткових патологій, травм та інших дефектів.