В процесі проростання підвищується обмін речовин у зародку та ендоспермі; насіння набухають у воді, крохмаль, жири та білки розпадаються на цукор, жирні кислоти та амінокислоти. Зазвичай першим проростає корінець, далі – гіпокотиль або епікотиль (у різних рослин).
Насіння розвивається на поверхні насіннєвої луски. Воно є багатоклітинною структурою, що об'єднує запасну тканину – ендосперм, зародок і спеціальний захисний покрив (насіннєву шкірку). До запліднення у центральній частині сім'язачатка є нуцеллус, який поступово витісняється ендоспермом.
У розвитку рослини прийнято виділяти такі етапи: 1) ембріональний; 2) ювенільний; 3) етап зрілості та розмноження; 4) сенільний. Ембріональний етап онтогенезу насіннєвих рослин – розвиток зародка від зиготи до дозрівання насіння включно.